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  • 給分子裝上“GPS + 驗(yàn)金筆”:三維目標(biāo)鎖定單分子光譜動(dòng)態(tài)顯微鏡

    作者:深圳灣實(shí)驗(yàn)室 來源:投稿 時(shí)間:2025-10-01 16:29 閱讀:438 [投稿]
    深圳灣實(shí)驗(yàn)室侯尚國(guó)團(tuán)隊(duì)聯(lián)合哈爾濱工業(yè)大學(xué)(深圳)張永兵團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)出三維目標(biāo)鎖定單分子光譜動(dòng)態(tài)顯微鏡(3D-SpecDIM),實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子三維運(yùn)動(dòng)軌跡與化學(xué)特性動(dòng)態(tài)變化的同步捕捉!

    近日,深圳灣實(shí)驗(yàn)室侯尚國(guó)團(tuán)隊(duì)聯(lián)合哈爾濱工業(yè)大學(xué)(深圳)張永兵團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)出三維目標(biāo)鎖定單分子光譜動(dòng)態(tài)顯微鏡(3D-SpecDIM),實(shí)現(xiàn)對(duì)生物分子三維運(yùn)動(dòng)軌跡與化學(xué)特性動(dòng)態(tài)變化的同步捕捉!該項(xiàng)研究在《自然通訊》(Nature communications)雜志在線發(fā)表。簡(jiǎn)單說,它能一邊“盯住”高速運(yùn)動(dòng)的單個(gè)分子在三維空間里的軌跡,一邊實(shí)時(shí)記錄分子的“顏色”/光譜如何隨微環(huán)境變化而漂移,把以往“要么看位置,要么看性質(zhì)”的兩難,一把梭解決。

    一句話看懂有何不同

    □ 以往:你能追蹤分子“去哪兒了”,卻很難同時(shí)知道它“變成了什么”。

    □ 現(xiàn)在:3D-SpecDIM同時(shí)測(cè)“位置信息(3D 軌跡)”和“化學(xué)信息(光譜峰位、形狀等)”,等于給分子裝上GPS與驗(yàn)金筆,動(dòng)態(tài)讀取它身邊微環(huán)境的酸堿度、極性、結(jié)合狀態(tài)等線索。


     

    3D-SpecDIM 裝置原理圖

    為什么是突破

    1.又快又準(zhǔn):系統(tǒng)只需拍一條譜線,就能把光譜對(duì)上號(hào),理論幀率可達(dá) 644 fps;在高光子數(shù)下,光譜定位精度做到0.3 nm量級(jí)。

    2.AI 加持:引入 Vision Transformer(帶域自適應(yīng),ViT_d),光譜定位精度相對(duì)傳統(tǒng)高斯擬合提升約 32%(1.63 nm → 1.11 nm)。

    3.單分子靈敏度:同時(shí)追蹤與成譜所需的最小單光子計(jì)數(shù)約5 kHz,與單熒光染料信號(hào)量級(jí)相當(dāng)。

    三個(gè)“硬核示范”,直觀說明它能干啥

    示范一:看清線粒體自噬“入酸之旅”

    研究把線粒體標(biāo)上 pH 傳感探針,同時(shí)監(jiān)測(cè)溶酶體信號(hào)。用光譜解混算出更“干凈”的比值曲線,測(cè)得溶酶體 pH≈4.5(與文獻(xiàn)一致);對(duì)照的雙通道強(qiáng)度比法卻給出 pH≈6,偏差明顯。多條軌跡顯示誘導(dǎo)組的 pH 比值下降更多、擴(kuò)散更快。此外,系統(tǒng)還能同時(shí)重建溶酶體的 3D 體積圖,把“點(diǎn)”的運(yùn)動(dòng)與“器官”的形態(tài)放在一張三維圖里看。


    3D-SpecDIM用于在活細(xì)胞中實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)線粒體自噬

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